Database List
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Last Updated 2020-4-16
Pharmaceuticals   | DB Type | Species | Name | Organization |
|---|---|---|---|---|
| others | otherdbs | Human | CGED(Cancer Gene Expression Database) | 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター |
| clinical_trials | otherdbs | Human | ClinicalTrials.gov | アメリカ国立医学図書館 |
| others | otherdbs | None specified | AOE[アーカイブデータ] | ライフサイエンス統合データベースセンター |
| chemical_compound | otherdbs | Plants | KNApSAcK (A Comprehensive Species-Metabolite Relationship Database) | 奈良先端科学技術大学院大学 |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human), Plants, Microbes | DBCLS SRA | 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター |
| others | otherdbs | None specified | PiSITE - 蛋白質の相互作用部位データベース | 東京大学 医科学研究所 |
| others | otherdbs | Human | 病気の解説 難病情報センター | 公益財団法人 難病医学研究財団 |
| others | otherdbs | Human | FLJ Human cDNA Database | 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター |
| others | otherdbs | None specified | KEGG ORTHOLOGY (Linking genomes to pathways by ortholog annotation) | 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター |
| others | otherdbs | None specified | researchmap | 独立行政法人科学技術振興機構 |
| others | otherdbs | Human | 病理コア画像 | 社団法人日本病理学会 |
| chemical_compound | otherdbs | Human | 薬剤の制ガン作用と関連する遺伝子発現変化・公開データベース | Screening Committee of Anticancer Drugs (SCADS) |
| clinical_trials | otherdbs | Human | 臨床研究情報ポータルサイト | 国立保健医療科学院 |
| others | otherdbs | Human, Plants | 食品機能成分データベース | 北海道医療大学 |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human) | COXPRESdb | 東京大学 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター |
| others | otherdbs | Plants | RAP-DB(Rice Annotation Project DataBase) | 国立研究開発法人農業生物資源研究所 |
| chemical_compound | otherdbs | Human, Animals (non-human) | Open TG-GATEs[アーカイブデータ] | 独立行政法人 医薬基盤研究所 創薬基盤研究部 トキシコゲノミクス・インフォマティクスプロジェクト |
| side_effects | otherdbs | None specified | 知のアーカイブ | 独立行政法人放射線医学総合研究所 |
| chemical_compound | otherdbs | None specified | 核酸医薬品データベース[アーカイブデータ] | 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター |
| others | otherdbs | Human | 感染症の情報（感染源や特徴で探す） | 国立感染症研究所 |
| others | otherdbs | Microbes | Trypanosomes Database[アーカイブデータ] | 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 |
| others | otherdbs | Human | VarySysDB | 独立行政法人産業技術総合研究所 |
| others | otherdbs | Human | 循環器トライアルデータベース | ライフサイエンス出版株式会社 |
| others | otherdbs | None specified | KEGG BRITE(Functional hierarchies and binary relationships of biological entities) | 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human) | MCPA2 | 獨協医科大学 |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human), Plants, Microbes | BMRB(Biological Magnetic Resonance Data Bank) | University of Wisconsin System Board of Regents |
| otherdbs | Microbes | eSOL(Solubility database of all E.coli proteins) | 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 | |
| others | otherdbs | Human | National BioResource Project Human embryonic stem cells (ヒトES細胞プロジェクト情報公開ページ) | 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生物遺伝資源情報総合センター |
| others | otherdbs | Human, Plants | Food Composition Database (食品成分データベース) | 独立行政法人科学技術振興機構 |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human), Plants, Microbes | 遺伝子名称シソーラス[アーカイブデータ] | ライフサイエンス統合データベースセンター |
| others | otherdbs | Human | GeMDBJ | 医薬基盤研究所 |
| others | otherdbs | Human | 厚生労働省指定難病 | 厚生労働省 |
| effects | otherdbs | Human | 話題の食品・成分 | 国立健康栄養研究所 |
| others | otherdbs | Human | 感染症発生動向調査 | 国立感染症研究所 |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human), Plants, Microbes | HitPredict (A database of high confidence protein-protein interactions) | 東京大学 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human), Plants, Microbes | 3D Electron Microscopy (3D-EM) Data Navigator | 大阪大学 蛋白質研究所 |
| others | otherdbs | None specified | KEGG RCLASS | 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター |
| others | otherdbs | Microbes | MiFuP Safety | 独立行政法人製品評価技術基盤機構 |
| others | otherdbs | Human | 統合がんゲノムデータベース | 公益財団法人 がん研究会 |
| chemical_compound | otherdbs | None specified | KEGG COMPOUND (Metabolome informatics resource integrating genomics and chemistry) | 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human), Plants, Microbes | HINTdb(Homologous Interactions Database) | 東京大学 医科学研究所 |
| side_effects | otherdbs | None specified | 中毒情報データベース | 日本中毒情報センター |
| others | otherdbs | Human | 病原体検出マニュアル | 国立感染症研究所 |
| others | otherdbs | Human, Plants | 「健康食品」の安全性・有効性情報 ー 素材情報データベース | 独立行政法人国立健康・栄養研究所 |
| others | otherdbs | Microbes | MicrobeDB.jp | 東京工業大学 |
| others | otherdbs | None specified | PMD(Protein Mutant Database) | 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 |
| others | otherdbs | Human | KEGG DISEASE (Diseases viewed as perturbed states of the molecular system) | 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター |
| others | otherdbs | None specified | KEGG PATHWAY Database (Wiring diagrams of molecular interactions, reactions, and relations) | 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター |
| chemical_compound | otherdbs | None specified | 3DPSD: ３次元医薬品構造データベース | 東京薬科大学 薬学部 |
| kampo | otherdbs | Plants | 薬用植物総合情報データベース | 医薬基盤研究所 |
| others | otherdbs | Human | 健康食品の安全性・有効性情報の基礎知識 | 国立健康栄養研究所 |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human), Plants, Microbes | A web-based comparative genome browser between human and other vertebrate genomes (G-compass) | 独立行政法人産業技術総合研究所 |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human), Plants, Microbes | KEGG GENES Database (Molecular building blocks of life in the genomic space) | 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター |
| others | otherdbs | Human | RAvariome(Rheumatoid Arthritis variome) | 独立行政法人産業技術総合研究所 |
| others | otherdbs | Human | VaDE | 東海大学医学部 |
| kampo | otherdbs | Plants | 伝統医薬データベース | 富山大学 和漢医薬学総合研究所 |
| effects | otherdbs | Human | KEGG DRUG (Drugs viewed as perturbants to the molecular system) | 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター |
| others | otherdbs | Human | 感染症の情報 （疾患名で探す） | 国立感染症研究所 |
| others | otherdbs | Human | NBDCヒトデータベース | 独立行政法人科学技術振興機構 バイオサイエンスデータベースセンター |
| side_effects | otherdbs | Human | 国際化学物質安全性カード(ICSC) | 国立医薬品食品衛生研究所(NIHS) |
| chemical_compound | otherdbs | None specified | DDIDA | 京都大学 |
| others | otherdbs | Human | ウェブ版血管炎病理アトラス | 難治性血管炎に関する調査研究班 |
| others | otherdbs | Human | DDPC | King Abdullah University of Science and Technology |
| others | otherdbs | Human | 血液腫瘍画像データベース (Hematological malignancy image database) | 国立病院機構九州がんセンター |
| others | otherdbs | Human | Gastrointestinal Medical Image Database (消化管医用画像データベース) | 国立病院機構九州がんセンター |
| others | otherdbs | Human | 統合失調症の脳内遺伝子発現プロファイル | 新潟大学 脳研究所 基礎神経科学部門 分子神経生物学分野 |
| others | otherdbs | None specified | EzCatDB(A Database of Enzyme Catalytic Mechanisms) | 独立行政法人産業技術総合研究所 |
| others | otherdbs | Human | 感染症流行予測調査 | 国立感染症研究所 |
| otherdbs | None specified | PPI view(Protein-Protein Interaction viewer) | 独立行政法人産業技術総合研究所 | |
| chemical_compound | otherdbs | None specified | KEGG REACTION (Knowledge base for predicting biodegradation and biosynthesis) | 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター |
| chemical_compound | otherdbs | Human, Animals (non-human) | Open TG-GATEs | 医薬基盤研究所 |
| others | otherdbs | Human | 小児慢性特定疾病情報センター | 小児慢性特定疾病情報センター |
| others | otherdbs | Microbes | MBGD(Microbial Genome Database for Comparative Analysis) | 自然科学研究機構 基礎生物学研究所 |
| others | otherdbs | Human | Cancer Image Reference Database | 独立行政法人国立がん研究センター |
| chemical_compound | otherdbs | Plants | KNApSAck Family | 奈良先端科学技術大学院大学 |
| chemical_compound | otherdbs | None specified | RaDaP | 独立行政法人放射線医学総合研究所 |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human) | FANTOM5 | 独立行政法人理化学研究所 横浜研究所 |
| others | otherdbs | None specified | RESOPS | お茶の水女子大学 大学院人間文化創成科学研究科 |
| chemical_compound, side_effects | otherdbs | Human | 既存化学物質毒性データベース (Japan Existing Chemical Data Base) | 厚生労働省 国立医薬品食品衛生研究所 |
| others | otherdbs | None specified | Metabolonote | 独立行政法人理化学研究所 横浜研究所 |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human) | TargetMine | 医薬基盤研究所 |
| clinical_trials | otherdbs | Human | The New England Journal of Medicine（NEJM） | The New England Journal of Medicine（NEJM） |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human), Plants, Microbes | PDBj(Protein Data Bank Japan) | 大阪大学 蛋白質研究所 |
| others | otherdbs | Microbes | Mycoplasma penetrans Genome | 厚生労働省 国立感染症研究所 |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human), Plants, Microbes | OLIGAMI(Oligomer Architecture and Molecular Interface) | 創価大学 |
| chemical_compound | otherdbs | None specified | SuperSweet | Charité - Universitätsmedizin Berlin |
| side_effects | otherdbs | Human | 被害関連情報 | 国立健康栄養研究所 |
| others | otherdbs | Human | H-InvDB(H-Invitational Database) | 独立行政法人産業技術総合研究所 |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human) | DBTSS(Database of Transcriptional Start Sites) | 東京大学 医科学研究所附属ヒトゲノム解析センター |
| others | otherdbs | None specified | jPOSTリポジトリメタデータ[アーカイブデータ] | jPOSTチーム |
| others | otherdbs | Human | 3D MR Microscopic Images of Kyoto Collection of Human Embryos | 筑波大学 |
| others | otherdbs | Human | TMIG-2DPAGE Proteome Database | 地方国立研究開発法人東京都健康長寿医療センター |
| chemical_compound | otherdbs | Human | 抗体医薬品データベース[アーカイブデータ] | 産業技術総合研究所 創薬分子プロファイリング研究センター |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human) | Open TG-GATEs 病理写真データベース[アーカイブデータ] | 独立行政法人 医薬基盤研究所 創薬基盤研究部 トキシコゲノミクス・インフォマティクスプロジェクト |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human), Plants, Microbes | LipidBank | 日本脂質生化学会 (JCBL) |
| clinical_trials | otherdbs | Human | EU Clinical Trials Register | EU Clinical Trials Register |
| others | otherdbs | None specified | PSCDB | 名古屋大学大学院 情報科学研究科 |
| others | otherdbs | None specified | eF-site(electrostatic surface of Functional-site) | 大阪大学 蛋白質研究所 |
| chemical_compound | otherdbs | Human | PoSSuM[アーカイブデータ] | 産業技術総合研究所 人工知能研究センター |
| others | otherdbs | Human | 希少疾病用医薬品・希少疾病用医療機器 | 医薬基盤研究所 |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human), Plants, Microbes | ProMode(A database of normal mode analyses on protein molecules with a full-atom model) | 早稲田大学 |
| others | otherdbs | Human, Animals (non-human) | Genome Network Platform | 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 |
| others | otherdbs | Human | H-ANGEL(The Human Anatomical Gene Expression Library) | 独立行政法人産業技術総合研究所 |
| others | otherdbs | Human | SHOGoin | 京都大学 iPS細胞研究所 |
| effects | otherdbs | Human | 医薬品情報データベース | 一般財団法人日本医薬情報センター ¶ |
| clinical_trials | otherdbs | Human | 医薬品情報データベース臨床試験情報 | 一般財団法人日本医薬情報センター |